L'Anzhi Zelenodosk Junior è una squadra di calcio russa con sede a Zelenodosk, Daghestan. Attualmente milita nella Russian Professional Football League, la terza divisione del campionato russo di calcio.
La squadra è stata fondata nel 2014 come filiale dell'Anzhi Makhachkala, e ha iniziato a giocare nella Russian Amateur Football League, la quarta divisione del campionato russo di calcio. Nel 2018, l'Anzhi Zelenodosk Junior ha vinto il campionato e ha guadagnato la promozione alla Russian Professional Football League.
Nella stagione 2019-2020, l'Anzhi Zelenodosk Junior ha terminato al 10º posto nel Girone Sud della Russian Professional Football League. La squadra è stata allenata da Ruslan Agaev e il miglior marcatore della squadra è stato Magomed-Shapi Suleymanov, con 6 gol.
Nell'estate del 2020, l'Anzhi Zelenodosk Junior è stata sciolta e i suoi giocatori sono stati trasferiti all'Anzhi Makhachkala.
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