Panionios

Il club fu fondato nel 1890 a Smirne, allora impero ottomano, sotto il nome di Orpheus Music and Sports Club. Nel 1893 alcuni membri dell'Orpheus formarono un'organizzazione separata, il "Gymnasion Club" e iniziarono ad organizzare competizioni sportive annuali. Nel 1898 l'Orpheus e il Gymnasion si fusero di nuovo formando il PGSS. Dopo la sconfitta militare greca nella Guerra greco-turca (1919–1922) il club fu trasferito nel comune ateniese di Nea Smyrnī. Il club presto divenne famoso per occuparsi di tutti i principali sport e fu il primo club greco ad istituire una divisione di Atletica leggera femminile nel 1925. Con la graduale trasformazione del calcio e del basket maschile in sport professionistici, il Paniōnios FC e il Paniōnios BC divennero club privati operando sotto gli auspici dei tradizionali "sport dilettantistici" della PGSS.

Il Paniōnios ha passato quasi tutta la sua intera storia nella prima divisione greca (ora chiamata 'Superleague'), essendo stato estromesso dalla massima divisione greca solo due volte nella sua storia ultracentenaria. Il Paniōnios, insieme al Larissa e al PAOK Salonicco, si è spesso classificato nella Zona UEFA-Intertoto, dietro alle "big" AEK Atene, Panathinaikos e Olympiakos. Si è quindi affacciata diverse volte sullo scenario europeo.

Nel Panionios sono cresciuti i tre maggiori attaccanti greci degli anni ottanta, ossia Nikos Anastopoulos (poi dell'Olympiakos), Thomas Mavros (poi dell'AEK), e Dīmītrīs Saravakos (poi del Panathīnaïkos). Altri giocatori famosi cresciuti nel club sono stati Nikos Tsiantakīs (poi dell'Olympiakos) e Takis Fyssas, poi del Panathinaikos e membro della Nazionale greca.

Nel dicembre del 2001 il club fu ridenominato Neos Paniōnios FC (Nuovo Panionios FC) al fine di evitare la minaccia di retrocessione dalla prima divisione a causa di difficoltà finanziarie.

Il 5 settembre 2008 ingaggiò l'attaccante uruguaiano Álvaro Recoba, reduce da un'ultradecennale esperienza nel campionato italiano.

Il 26 aprile 2010 fu assunto l'allenatore svedese Mikael Stahre, esonerato il 28 ottobre dello stesso anno. Al suo posto fu richiamato Geōrgios Paraschos, tornato in panchina nel novembre 2010, ma dimessosi una settimana dopo. Parallelamente alla crisi di risultati, il club attraversò una situazione di caos amministrativo, dopo la decisione di Tsakiris di cedere il controllo del sodalizio. Il 10 dicembre 2010 la panchina fu affidata a Takīs Lemonīs, rimasto in carica fino alla decima giornata della stagione successiva. La riduzione del budget e la partenza dei giocatori chiave furono tra le cause della partenza di Lemonīs, rimpiazzato da Apostolos Mantzios, che mantenne il ruolo sino alla fine della stagione 2011-2012, riuscendo a salvare la squadra dalla retrocessione.

Nel 2012-2013 il club fu costretto a fare affidamento su giovani giocatori provenienti dal vivaio con poche aggiunte, in quanto non poteva ingaggiare, a causa di gravi problemi finanziari, giocatori di età superiore a 23 anni. In questa fase difficile, il ruolo di allenatore fu assunto dall'ex portiere Dīmītrios Eleutheropoulos, subentrato a stagione in corso e all'esordio come tecnico. Pur con un organico pieno di giovani, il nuovo allenatore riuscì a disputare un ottimo girone d'andata, ciuso dalla squadra vicino alla vetta della classifica, ma una serie di risultati negativi nelle seguenti giornate portò all'esonero di Eleutheropoulos, sostituito da Kostas Panagopoulos.

Il bando ai trasferimenti imposto dalle autorità calcistiche nazionali al club fu esteso alla stagione 2013-2014, segnata da perduranti problemi finanziari, mentre la maggior parte dei giocatori esperti come Goundoulakis, Siderakis, Rokas, Andralas lasciarono il club, seguiti poco dopo da Kostas Mendrinos. Fu Nikos Pantelis a guidare la squadra nella prima parte del campionato, portando risultati soddisfacenti, ma la dirigenza decise di sostituirlo con Kostas Panagopoulos. Nella seconda parte del torneo la squadra si trovò in una posizione difficile, così per le ultime dieci partite di campionato fu chiamato in panchina l'esperto Nikos Anastopoulos, che alla fine riuscì a salvare il club dalla retrocessione.

Nonostante la crisi finanziaria, durante questo periodo i rossoblù misero in mostra alcuni giocatori di talento provenienti dal settore giovanile, molti dei quali facevano parte delle nazionali giovanili greche e la maggior parte dei quali furono poi ceduti ad altri club. Tra questi si ricordano Maniatis, Siovas, Samaris, Kolovos, Avlonitis (passato all'Olympiakos), Kontoes, Arabidis, Dounis, Anestis, Lambropoulos (ceduto all'AEK Atene), P. Spyropoulos (ceduto al Panathīnaïkos), Kouros (all'Atromītos), Peristeridis (al Platanias).

La stagione 2014-2015 iniziò con il club ancora costretto a rinunciare a calciatori di età superiore a 23 anni (ad eccezione di tre fuoriquota) e per un altro anno dovette puntare sui ragazzi delle giovanili, ma riuscì a rimanere nella categoria, finendo al tredicesimo posto. Nel 2015-2016 ottenne un ottimo quinto posto, assicurandosi la sua partecipazione ai play-off del campionato e allo stesso tempo la qualificazione all'Europa League, cui non poté, tuttavia, prendere parte perché non ottenne la licenza UEFA (il suo posto fu preso dal PAS Giannina, che era arrivato sesto).

Nel campionato 2016-2017 chiuse nuovamente al quinto posto, partecipando per il secondo anno consecutivo ai play-off del campionato e garantendosi al contempo la qualificazione all'Europa League. Settimo nel 2017-2018, concluse al sesto posto nel 2018-2019, mentre nella stagione successiva retrocesse in seconda serie a causa dell'ultimo posto finale. Nel 2020-21 la squadra del Panionios è ripartita dal campionato regionale Gamma Ethniki, nel gruppo 6.