La nazionale di calcio femminile dell'Estonia è la squadra nazionale di calcio femminile dell'Estonia. È posta sotto l'egida della Federazione calcistica dell'Estonia (EJL).

Come membro dell'UEFA partecipa a vari tornei di calcio internazionali, come al Campionato mondiale FIFA e al Campionato europeo UEFA. Al 24 giugno 2016 occupa l'83ª posizione nel Ranking FIFA.

L'Estonia femminile è la squadra nazionale di calcio femminile dell'Estonia, la selezione rappresentativa delle calciatrici estoni nelle competizioni internazionali. La squadra venne fondata nel 1993, ed è guidata dalla Federazione calcistica dell'Estonia.

L'Estonia femminile non ha mai preso parte né a un Campionato mondiale né a un Campionato europeo. La nazionale ha tuttavia ottenuto alcuni successi in manifestazioni amichevoli, come nel 1997, quando vinse i campionati baltici, o nel 2012, quando ottenne il primo posto alla Cyprus Cup.

L'Estonia femminile ha inoltre partecipato a diverse edizioni dell'Algarve Cup, prestigioso torneo internazionale organizzato in Portogallo, dove ha ottenuto buoni risultati, come nel 2014, quando raggiunse la semifinale.

Tra le calciatrici più famose della nazionale estone figurano:

- Kätlin Viikmäe, difensore, attualmente giocatrice del Flora Tallinn;
- Liis Lindmaa, attaccante, attualmente giocatrice del Flora Tallinn;
- Signy Aarna, centrocampista, attualmente giocatrice del Flora Tallinn;
- Liis Emajõe, portiere, attualmente giocatrice del Flora Tallinn.

L'Estonia femminile è una squadra in crescita, e negli ultimi anni ha ottenuto risultati incoraggianti. La nazionale ha tutte le carte in regola per raggiungere traguardi importanti in futuro, magari partecipando per la prima volta a un grande torneo internazionale.