Il Fotbal Club Academia Chișinău è una società calcistica moldava con sede nella città di Chișinău, fondata nel 2006. Nella stagione 2012-13 milita nella Divizia Națională.
Il club è stato fondato da Igor' Dobrovol'skij, Alexandru Cojuhari e Eduard Rotari il 2 giugno 2006 con l'obiettivo di valorizzare giovani giocatori che non trovavano spazio negli altri club. In un programma televisivo annunciarono l'allestimento di un campus per selezionare giocatori tra i 16 e i 20 anni in cui parteciparono più di 300 candidati.
Esordisce in Divizia A nella stagione 2006-07 col nome FC Academia e l'anno successivo viene promosso in Divizia Națională.
All'inizio della stagione 2008-2009, a seguito di un accordo con il politecnico della capitale cambia nome in FC Academia UTM. Il primo campionato nella massima serie è concluso al penultimo posto, dopodiché seguono campionati conclusi a metà classifica.
A partire dalla stagione 2012-2013 cambia nuovamente denominazione in FC Academia