Il FCI Tallinn II è una squadra di calcio estone con sede a Tallinn. È la squadra riserve del FCI Levadia Tallinn, che gioca nella Meistriliiga, la massima serie del campionato estone.

Il FCI Tallinn II gioca nella Esiliiga, la seconda serie del campionato estone. La squadra è stata fondata nel 1998 e ha vinto la Esiliiga una volta, nella stagione 2016.

Il FCI Tallinn II gioca le partite casalinghe allo stadio Kalevi Keskstaadion di Tallinn, che ha una capacità di 10.000 spettatori.

I colori sociali del FCI Tallinn II sono il bianco e il nero.