L'Happy Valley viene fondato il giorno di Capodanno del 1950 da alcuni giovani residenti a Hong Kong in cerca di attività ricreative dopo il lavoro. L'amore per il calcio li spinse a formare una squadra di calcio e il nome Happy Valley gli venne in mente in quanto area della città in cui molti membri fondatori erano cresciuti. Ciononostante, la squadra non viene ufficialmente riconosciuta dalla federazione calcistica di Hong Kong fino al 1958, quando entrò a far parte della First Division League. In quella stessa stagione, l'Happy Valley fece la sua prima apparizione nella Hong Kong FA Cup, vincendo il trofeo per la prima volta nella sua storia. L'Happy Valley vinse il suo primo titolo di campionato nella stagione 1964-1965, battendo in finale il South China 2-0. L'Happy Valley ha vinto il campionato altre 8 volte, diventando una delle squadre più vincenti del campionato di Hong Kong. Tuttavia, la squadra è stata retrocessa in seconda divisione nella stagione 2002-2003. L'Happy Valley è tornata in prima divisione nella stagione 2005-2006, e da allora ha continuato a giocare nella massima serie di Hong Kong. L'Happy Valley ha vinto anche la Hong Kong FA Cup altre 8 volte, e la Hong Kong Senior Shield 4 volte. L'Happy Valley è una delle squadre di calcio più antiche e più titolate di Hong Kong, e ha una lunga storia di successi.