L'Universitario Beni è una squadra di calcio boliviana con sede a Trinidad, fondata nel 2005. Il club gioca le sue partite casalinghe presso lo stadio Gran Mamoré.
L'Universitario Beni ha vinto un titolo nazionale di seconda divisione nel 2008, ottenendo così la promozione in massima serie. La squadra ha partecipato alla massima divisione boliviana per cinque stagioni consecutive, dal 2009 al 2013, ottenendo come miglior risultato un sesto posto nel Clausura 2010.
Nel 2014, l'Universitario Beni è retrocesso in seconda divisione, dove ha militato fino al 2017, quando ha ottenuto nuovamente la promozione in massima serie. La squadra ha partecipato alla massima divisione boliviana per due stagioni consecutive, dal 2018 al 2019, ottenendo come miglior risultato un ottavo posto nel Clausura 2018.
Nel 2020, l'Universitario Beni è retrocesso nuovamente in seconda divisione, dove milita attualmente.
L'Universitario Beni ha partecipato a due edizioni della Copa Sudamericana, nel 2010 e nel 2018, in entrambe le occasioni venendo eliminato al primo turno.
I colori sociali dell'Universitario Beni sono il rosso e il bianco.
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