Il Mérida Asociación Deportiva è una società calcistica spagnola con sede nella città di Mérida, nella comunità autonoma dell'Estremadura.
Il club è stato rifondato il 19 febbraio 2013 e in 6 giorni, il 25 febbraio, è stato registrato nel registro generale delle entità sportive dell'Estremadura. Il Mérida UD è stata sciolta più tardi nel 2013 e il Mérida AD ha acquistato il proprio posto in Tercera División.
Il 30 maggio 2015, il club è stato promosso in Segunda División B dopo aver battuto il CD Laredo 2–1 in forma aggregata nei playoff. Il 27 agosto di quell'anno, la squadra ha gareggiato per la prima volta nella Copa del Rey , perdendo 0–3 in casa contro il Peña Sport FC nella partita di apertura.
Nel 2017–18, al club è stato dato un addio al secondo turno della coppa, dove hanno perso 2-0 al CF Fuenlabrada. La stagione si è conclusa con la retrocessione al quarto livello dopo una sconfitta aggregata 2–2 (gol in trasferta) contro il Coruxo FC negli spareggi per retrocessione, ma la squadra è rimbalzata un anno dopo con una vittoria ai rigori contro l'UD Socuéllamos.