Il Pajapita FC è una squadra di calcio guatemalteca con sede a San José Pajapita, nel dipartimento di San Marcos. Fondato nel 1972, il club gioca nella Segunda División del campionato guatemalteco di calcio.

Lo stadio di casa del Pajapita FC è lo Stadio Municipal de San José Pajapita, che ha una capacità di 3.000 spettatori. I colori sociali della squadra sono il giallo e il nero.

Il Pajapita FC ha vinto il campionato di Segunda División nel 2016, ottenendo così la promozione in Primera División. Tuttavia, il club è retrocesso in Segunda División dopo una sola stagione.

Il Pajapita FC è una squadra molto popolare tra i tifosi locali, e le partite casalinghe sono sempre ben frequentate. La squadra è nota per il suo stile di gioco offensivo e per i suoi numerosi tifosi.

Alcuni dei giocatori più famosi che hanno militato nel Pajapita FC sono:

* Carlos Ruiz
* Juan Carlos Plata
* Marco Pappa
* José Manuel Contreras
* Ricardo Jerez