Il FC Rafalivka è una squadra di calcio ucraina fondata nel 2002 e con sede nella città di Rafalivka, nella regione di Rivne. La squadra milita attualmente nella Persha Liha, la seconda divisione del campionato ucraino di calcio.
La storia del FC Rafalivka inizia nel 2002, quando viene fondato come club amatoriale. Nel 2008, la squadra viene promossa nella Druha Liha, la terza divisione del campionato ucraino di calcio. Nel 2013, il FC Rafalivka vince il campionato della Druha Liha e viene promosso in Persha Liha.
La stagione 2013-2014 è la prima stagione del FC Rafalivka in Persha Liha. La squadra termina il campionato al 9° posto, conquistando così la salvezza. Nella stagione 2014-2015, il FC Rafalivka migliora il proprio rendimento e termina il campionato al 6° posto.
Nella stagione 2015-2016, il FC Rafalivka raggiunge la finale della Coppa d'Ucraina, ma viene sconfitto dal Shakhtar Donetsk per 2-0. Questa è la migliore prestazione della squadra in una competizione nazionale.
Nella stagione 2016-2017, il FC Rafalivka termina il campionato al 7° posto. Nella stagione 2017-2018, la squadra termina il campionato all'8° posto.
Nella stagione 2018-2019, il FC Rafalivka termina il campionato al 9° posto. Nella stagione 2019-2020, la squadra termina il campionato al 10° posto.
Nella stagione 2020-2021, il FC Rafalivka termina il campionato al 10° posto. Nella stagione 2021-2022, la squadra termina il campionato al 9° posto.